1.使用在线过滤器
在线过滤器放置在自动进样器和色谱柱（或保护柱）之间。-常见的-在线过滤器分为带可更换筛板（0.5μm或0.2μm）的不锈钢-在线过滤器和一次性PEEK。对于不同材质的在线过滤器，一般必须选择孔径比柱筛板小的筛板，以有效拦截可能堵塞色谱柱筛板的颗粒。一旦发现仪器的压力开始增加，则有可能-在线过滤器筛板开始堵塞，我们必须在其完全堵塞之前对其进行更新。
在线过滤器的功能与膜类似，但不需要任何额外的工作。-样品离心后，仍有可能有少量颗粒进入仪器，残留颗粒可被位于色谱柱前面的-在线过滤器拦截。另外，在线过滤器的优点是简单、易于更换。一般更换只需5分钟，即可重新启动使用，无需花时间重新调整或校准。另一个优点是，-在线过滤器还可以过滤掉仪器中某些零件老化磨损产生的颗粒。我强烈建议每台液相仪器都配备-在线过滤器。即使使用保护柱，我也建议在保护柱之前安装一个-在线过滤器。
2. 使用保护柱
保护柱是安装在色谱柱前面的短色谱柱。一般长1-2厘米，填料与所用柱的填料相匹配，所用筛板孔径不大于柱所用筛板孔径。保护柱有两个作用：（1）可以阻挡可能堵塞色谱柱的颗粒； (2)由于保护柱和柱填料是匹配的，任何可能与柱填料发生不可逆相互作用而未达峰的化学杂质都会首先被保护柱捕获。
使用保护柱绝对可以延长色谱柱的使用寿命。然而，在考虑是否使用保护柱之前，建议评估以下几点：
(1)保护柱价格不菲，考虑是否可以通过增加柱寿命来补偿购买保护柱的成本；
(2)保护柱的寿命有多长？需要注意何时需要更换保护柱，以免更换得太晚而污染色谱柱；
(3) 如何冲洗保护柱？冲洗时，保护柱和色谱柱需要分开冲洗，避免将保护柱内积聚的杂质冲洗到色谱柱中；
(4) 不要指望因添加 1-2 cm 保护柱而提高柱效。虽然安装保护柱与增加柱长类似，但使用保护柱也会增加两个接头和连接管，这会降低仪器系统的柱效，所以如果能保持没有保护柱的柱效就好了。
不用说，使用保护柱固然可以延长柱寿命，但建议每个实验室从经济性和省力方面评估是否需要保护柱。即使有保护柱，我也建议在保护柱和自动进样器之间放置一个-在线过滤器，毕竟更换-在线过滤器比更换保护柱便宜，并且可以延长保护柱和色谱柱的使用寿命。
3. 请勿输入未经处理的样品
无论是否进行预处理，-都建议在进样前对所有样品进行过滤或离心。例如，当样品通过滤膜过滤以去除颗粒从而减少色谱柱筛板的堵塞时，滤膜的孔径必须小于色谱柱筛板的孔径。一般颗粒大于3μm的色谱柱采用2μm筛板，3μm颗粒的色谱柱采用0.5μm筛板，小于3μm颗粒的色谱柱一般采用0.2μm筛板，所以一般0.45μm过滤器基本上可以用于除2μm以下颗粒以外的所有色谱柱；对于亚2μm颗粒的色谱柱，通常使用0.2μm孔径的过滤器。大多数滤膜都是预先包装好的，可以直接连接到注射器上进行过滤或用作96孔板中的滤板。